Caracterización molecular de tres aislados fúngicos obtenidos de la Reserva Ecológica Manglares Churute
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Fecha
2020-06
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Editor
Facultad de Ciencias Naturales, Universidad de Guayaquil
Resumen
Los ecosistemas de manglar por sus condiciones fisicoquímicas confieren un hábitat idóneo para el desarrollo de hongos, predominantemente el grupo de los ascomicetos marinos manglícolas que pueden encontrarse en material lignocelulósico de plantas de mangle. El objetivo de la presente investigación fue caracterizar molecularmente tres aislados fúngicos de la Reserva Ecológica Manglares Churute mediante el análisis de las secuencias de ADNr de las regiones ITS, LSU y TEF1-α, y evaluar el mejor método de extracción de ADN genómico fúngico por lisis celular mecánica. Los resultados demostraron que el mejor método de extracción de ADN fue el método combinado de lisis celular mecánica con mortero, vórtex y perlas de acero. Se identificó molecularmente tres ascomicetos, dos a nivel de especie correspondientes a Verruculina enalia y Aigialus parvus con porcentajes de similitud de identidad superiores a 99.00% con las tres regiones, presentando los mayores porcentajes con LSU, con valores de 99.88% y 100%, e ITS con 99.80% para V. enalia, mientras que para A. parvus, LSU e ITS presentaron valores de 100%. El aislado restante se logró identificar a nivel de género establecido como Cladiophialophora sp., únicamente con la región LSU, con porcentajes de identidad de 98.70% y 99.86%, con la región TEF1-α se obtuvo un porcentaje de 93.80% para el mismo género, mientras que con la región ITS no se pudo realizar el análisis debido a que la secuencia obtenida salió contaminada. Concluyendo que las tres regiones evaluadas permiten determinar la taxonomía y relaciones filogenéticas de ascomicetos.